Wer eine Arztpraxis betreibt, kennt das Phänomen: Der Umsatz stimmt, aber am Jahresende bleibt weniger übrig als erwartet. Das liegt selten an den Betriebskosten allein. Häufig fehlt eine strukturierte Steuerstrategie, die auf die spezifische Situation niedergelassener Ärzte zugeschnitten ist. 2026 bringt dabei einige Veränderungen und Fristen, die konkrete Entscheidungen erfordern.
Rechtsform und Gewinnermittlung: Die Grundentscheidung sitzt tief
Viele Ärzte praktizieren als Einzelunternehmer oder in einer Gemeinschaftspraxis als GbR. Das ist steuerlich nicht automatisch nachteilig, kann aber je nach Einkommenshöhe erheblich teurer sein als alternatives Modell. Eine Partnerschaftsgesellschaft (PartG) oder, in bestimmten Konstellationen, eine MVZ-GmbH bieten andere Gestaltungsspielräume, vor allem bei der Gewinnverteilung und der Thesaurierungsoption.
Relevant ist hier der Unterschied zwischen der Einnahmen-Überschuss-Rechnung (EÜR) und der Bilanzierung. Praxen unter einem Jahresumsatz von 600.000 Euro oder einem Jahresgewinn unter 60.000 Euro sind nicht zur Bilanzierung verpflichtet. Die EÜR lässt aber bestimmte Gestaltungen zu, die bei der Bilanzierung anders behandelt werden. Wer kurz vor einer Praxiserweiterung steht, sollte prüfen, ob ein Wechsel der Gewinnermittlungsmethode sinnvoll ist.
Investitionsabzugsbetrag: Spielraum bis 200.000 Euro nutzen
Der Investitionsabzugsbetrag (IAB) nach Paragraf 7g EStG ist eines der wirksamsten Werkzeuge für niedergelassene Ärzte. Er erlaubt, bis zu 50 Prozent geplanter Investitionen in Wirtschaftsgüter schon vor dem Kauf gewinnmindernd abzuziehen, maximal 200.000 Euro kumuliert. Wer also plant, 2027 ein neues Ultraschallgerät für 80.000 Euro anzuschaffen, kann bereits in der Steuererklärung 2025 oder 2026 bis zu 40.000 Euro gewinnmindernd geltend machen.
Wichtig: Der IAB muss innerhalb von drei Jahren durch eine tatsächliche Investition aufgelöst werden. Bleibt die Anschaffung aus, droht eine Nachversteuerung inklusive Zinsen. Sorgfältige Investitionsplanung ist also Voraussetzung. Praxisinhaber, die mehrere Investitionen in den nächsten Jahren planen, sollten den IAB gestaffelt und koordiniert einsetzen, nicht pauschal ausschöpfen.
Umsatzsteuerbefreiung: Fallstricke bei Zusatzleistungen
Ärztliche Heilbehandlungen sind nach Paragraf 4 Nr. 14 UStG grundsätzlich umsatzsteuerfrei. Das entlastet die Praxis, schließt aber den Vorsteuerabzug für entsprechende Ausgaben aus. Problematisch wird es bei gemischten Leistungen: Gutachten, Atteste, kosmetische Eingriffe oder Sportmedizin ohne therapeutischen Bezug sind umsatzsteuerpflichtig.
Viele Praxen, die ihr Angebot in den letzten Jahren erweitert haben, unterschätzen diesen Bereich. Wer Selbstzahlerleistungen anbietet, sollte exakt prüfen, welche Leistungen steuerpflichtig sind und ob eine getrennte Buchführung notwendig ist. Das Finanzamt schaut hier genauer hin als früher, besonders bei Praxen mit deutlich wachsenden Einnahmen aus IGeLn oder Wellnessangeboten.
Praxisgemeinschaft oder Berufsausübungsgemeinschaft: steuerlich nicht gleich
Eine Praxisgemeinschaft teilt nur Räume und Infrastruktur, die Ärzte rechnen separat ab. Eine Berufsausübungsgemeinschaft (BAG) dagegen behandelt und rechnet gemeinsam ab. Dieser Unterschied hat steuerliche Konsequenzen: In der BAG werden Gewinne gemeinsam festgestellt und dann nach vereinbartem Schlüssel verteilt. Eine Steuerberatung für Ärzte in Köln mit Spezialisierung auf Heilberufe kann helfen, die für die konkrete Konstellation optimale Struktur zu wählen und Fehler bei der Vertragsgestaltung zu vermeiden.
Wer in einer BAG tätig ist, sollte außerdem prüfen, ob der Gewinnverteilungsschlüssel noch zur tatsächlichen Leistungserbringung passt. Abweichungen können vom Finanzamt als verdeckte Gewinnausschüttung oder missbräuchliche Gestaltung gewertet werden, wenn keine sachliche Grundlage erkennbar ist.
Altersvorsorge steuerlich effizient gestalten
Niedergelassene Ärzte sind in der Regel Pflichtmitglieder im ärztlichen Versorgungswerk. Beiträge dazu sind als Sonderausgaben absetzbar, derzeit bis zu einem Höchstbetrag von 27.566 Euro (2025, für Ledige). Wer darüber hinaus vorsorgen möchte, hat mehrere Optionen:
- Rürup-Rente: Beiträge bis zu 27.566 Euro absetzbar (2025), wird bis 2025 zu 100 Prozent anerkannt. Für Selbstständige mit hohem Einkommen besonders relevant.
- Betriebliche Altersvorsorge über MVZ-GmbH: Wer als angestellter Arzt im eigenen MVZ tätig ist, kann über eine Direktzusage erhebliche Mittel steuerfrei ansparen.
- Investitionen in Praxisimmobilien: Eigentum an den genutzten Räumen kann steuerlich vorteilhaft sein, erfordert aber klare vertragliche Trennung zwischen Praxis und Privat.
Die Kombination aus Versorgungswerk und Rürup-Rente ist für viele Ärzte bereits ausgereizt, bevor private Ersparnisse fließen. Deshalb lohnt ein Blick auf die Gesamtstruktur, nicht nur auf einzelne Instrumente.
Was 2026 konkret auf der Agenda stehen sollte
Einige steuerliche Fristen und Veränderungen betreffen Arztpraxen ab 2026 direkt. Die verpflichtende E-Rechnung im B2B-Bereich greift schrittweise, ab Januar 2027 müssen auch kleinere Praxen empfangsbereit sein. Wer Lieferanten hat, die bereits 2026 elektronisch abrechnen, muss die technische Infrastruktur entsprechend anpassen. Das ist kein rein buchhalterisches Thema, sondern hat Konsequenzen für Softwaresysteme und Praxisverwaltung.
Zudem läuft für Praxen, die im Rahmen der Corona-Pandemie Überbrückungshilfen oder KfW-Kredite erhalten haben, teilweise noch die Prüfphase. Wer hier noch offene Bescheide hat oder Rückforderungen erwartet, sollte das steuerlich frühzeitig einplanen, damit keine unerwarteten Nachzahlungen entstehen.
Schließlich lohnt der Blick auf die Gewerbesteuer: Ärzte üben eine freiberufliche Tätigkeit aus und sind grundsätzlich nicht gewerbesteuerpflichtig. Wer jedoch gewerbliche Elemente in die Praxis integriert, etwa den Verkauf von Nahrungsergänzungsmitteln oder Kosmetika, riskiert eine Abfärbung auf die gesamte Tätigkeit. Das Finanzgericht Münster hat 2023 in einem viel beachteten Urteil klargestellt, dass schon geringe gewerbliche Einnahmen die gesamte Praxis in die Gewerbesteuerpflicht ziehen können. Wer solche Aktivitäten plant, sollte sie sauber auslagern.
Steueroptimierung für Arztpraxen ist kein Einmalprojekt zum Jahresende, sondern ein laufender Prozess. Wer die wesentlichen Stellschrauben kennt und frühzeitig plant, schafft finanzielle Spielräume, die sich direkt in der Liquidität der Praxis niederschlagen.
